Japón, siglo XVIII. Los sogunes Tokugawa gobiernan el país, que se ha aislado del resto del mundo. La causa: una epidemia que se ceba con la población masculina. Ahora, los escasos varones son criados entre algodones mientras las mujeres realizan las labores más arduas, del campo al gobierno. Solo la sogún posee en su castillo un harén de hombres traídos de todo el país. Ese lugar es el Ooku, los Aposentos Privados.

Sin embargo, Yoshimune de Kii, VIII sogún Tokugawa, es consciente de que la nación no cuenta con guerreros para protegerla y quedaría indefensa ante posibles ataques de potencias extranjeras. Por eso encomienda a Tanuma Okitsugu, una joven y prometedora política, cierta misión de gran importancia: reunir dentro de los Aposentos Privados a un grupo de estudiosos para formarlos en medicina holandesa y hallar una cura para la viruela rostrograna.